La principale menace qui pèse sur cette espèce est la perte et la fragmentation de son habitat. La région de San Martín a subi un intense processus d'immigration en raison de nombreux programmes de développement social axés sur le secteur agricole, sans tenir compte de la durabilité de la région. Cela a favorisé la déforestation et la dégradation des sols à travers les activités les plus importantes : la culture du riz, du café et du cacao, l'élevage et l'extraction sélective du bois.
La déforestation à San Martín s'est accentuée dans les zones plates, coïncidant dans ce cas avec l'habitat de l'espèce. San Martín est la région la plus déboisée du Pérou, son taux de déforestation élevé est estimé entre 40 000 et 100 000 hectares/an, ce qui a provoqué la perte d'environ 40 % de son couvert forestier, habitat de l'espèce. L'habitat a été réduit à de petits fragments, où les échanges génétiques entre populations isolées sont presque impossibles, rendant l'espèce très vulnérable à l'extinction.
Une autre menace pour l'espèce est la chasse, soit pour sa propre consommation, soit pour la vente comme animal de compagnie. La fragmentation continue de l'habitat et l'épuisement de la macrofaune consommée comme viande de brousse ont orienté la consommation illégale de viande de brousse vers des espèces qui ne sont normalement pas chassées, comme le singe titi de San-Martín. Bien qu’il ne s’agisse pas d’une espèce source de nourriture notable, la fragmentation de l’habitat facilite l’entrée des chasseurs.
